Master Microbiologie
Durée d’étude : 2 ans
Nombre de crédits : 120
Lieu(x) de la formation : Nancy
Ce Master apporte les compétences indispensables aux cadres exerçant dans les différents domaines où le microbe est central ; que ce soit favorablement (biotechnologies ou écosystèmes naturels), ou défavorablement (microorganismes pathogènes ou affectant un procédé industriel) et concerne aussi bien la Recherche que la Technologie.
Le master concerne la majorité des domaines de la microbiologie, vous pourrez en M2 vous spécialiser vers le domaine industriel (contrôle qualité ou procédés bioindustriels), environnemental et de l’hygiène (orientation MESI) ou approfondir des compétences en microbiologie moléculaire avec immersion en laboratoire (Orientation RIM).
Le Master est support du CMI BioMIM (Cursus Master en Ingénierie Biotechnologies en Microbiologie et Ingénierie Moléculaire, Réseau Figure bénéficiant du label EUR-ACE®).
La formation intègre 8 mois de stage en entreprise.
| Niveau d’admission | Bac +3 |
| Modalités d’études | Présentiel |
| Stages | Oui |
| Alternance | Oui (contrat d’apprentissage et contrat de professionnalisation pour l’orientation MESI en M2) |
| Éligible au Compte Personnel de Formation (CPF) | Oui (uniquement en M2) |
| Possibilité de participer à un programme d’échange international | Oui / stage possible à l’étranger |
| Laboratoires liés à cette formation | DynAMic ; LCPME ; IAM ; LIEC ; LIBio ; LRGP ; SIMPA ; LSE ; UR-AFPA LAE ; LORIA ; |
La première année du master (M1) avec les semestres S7 et S8 se concentre sur l’enseignement :
• d’un socle de connaissances de bases dans la discipline,
• de méthodologies spécifiques à la discipline,
• d’UE transversales et d’internationalisation.
Vous réalisez un stage professionnel de 2 à 4 mois au S8.
À noter : au S8, vous devez choisir deux des 4 UE de spécialisation :
• Biofilms des milieux naturels, industriels et médicaux,
• Data analysis in R,
• Microbiologie alimentaire,
• Dissémination de l’antibiorésistance : un enjeu en santé.
Le Master Microbiologie n’a pas de parcours type. En revanche, il possède 2 orientations (ORI). En deuxième année de Master (M2), vous devez donc choisir parmi ces 2 ORI :
• Recherche et Innovation en Microbiologie Moléculaire – Research in Microbiology,
ou
• Microbiologie Environnementale Sanitaire et Industrielle
À noter, au dernier semestre (S10), vous réalisez un stage de cinq à six mois. Soit, au total, entre 7 et 10 mois d’expérience professionnelle sur le terrain.
Domaines de connaissances de la formation
- Microbiologie fondamentale (bactéries et archées, virologie, mycologie),
- Biostatistique et bio-informatique (dont analyses des données biologiques dans R),
- Écologie microbienne,
- Omique (génomique, protéomique et transcriptomique),
- Régulations et expression du génome,
- Démarche qualité et prévention des risques,
- Contrôles sanitaires,
- Bioremédiation,
- Microbiologie clinique,
- Biofilms,
- Bioréacteurs et fermentations industrielles,
- Microbiologie alimentaire.
Programme du Master Microbiologie
Le Master Microbiologie de la Faculté des Sciences et Technologies est organisée pour vous permettre une spécialisation progressive. La première année de Master (M1) est généraliste et porte sur les connaissances de base en Microbiologie. La deuxième année est plus spécialisée et plus pointue et vous permet d’approfondir le domaine dans lequel vous souhaitez exercer plus tard.
À noter, l’Orientation Recherche et innovation en microbiologie moléculaire a une approche pédagogique originale basée sur des ateliers-projets (60 % en immersion en laboratoire), l’orientation Microbiologie Environnementale Sanitaire et Industrielle est construite de manière plus classique.
Les orientations du Master Microbiologie de la FST de Nancy se font en deuxième année de Master.
- Recherche et Innovation en Microbiologie moléculaire – Research in Microbiology
- Microbiologie Environnementale Sanitaire et Industrielle
L’orientation Recherche et Innovation en Microbiologie moléculaire (RIM) est essentiellement basée sur une approche pédagogique par projets (60 % en immersion en laboratoire). Elle comporte notamment 3 grosses Unités d’Enseignement (18 ECTS sur les 30 du semestre) axées sur :
• la génomique,
• la protéomique,
• et la transcriptomique.
Vous suivez aussi des cours d’anglais scientifique, de projet professionnel et d’initiation au management. Vous suivez également des cours d’approfondissement en bioinformatique (génomes et algorithmes).
Enfin, vous devez choisir l’un des enseignements suivants :
• Plantes et microorganismes : des concepts aux applications,
• Interactions microorganismes – homme et impact en santé.
L’orientation RIM est à choisir si vous souhaitez vous spécialiser dans la biologie moléculaire et devenir ingénieur en Recherche et Développement (R&D), enseignant-chercheur ou autre type de postes dans ce domaine scientifique en particulier.
Avec l’orientation Microbiologie environnementale, sanitaire et industrielle (MESI), vous suivez 3 UE majeurs de 6 ECTS (crédits) :
• Qualité des milieux, contrôles et risques microbiens,
• Bioremédiation et valorisation des microorganismes,
• Bioréacteurs et fermentation.
Vous devez aussi choisir 2 UE parmi les 4 UE suivantes (6 ECTS) :
• la démarche qualité, environnement, sécurité, qualité et prévention des risques en milieu industriel,
• la bioinformatique (génomes et algorithmes),
• les interactions plantes – microorganismes,
• la microbiologie clinique.
Cette orientation vous permet de vous spécialiser plutôt dans les domaines industriels (contrôle qualité ou procédés bioindustriels), environnementaux ou liés à l’hygiène (milieux environnementaux naturels, industriels ou hospitaliers).
Poursuite d’études
Après un Master Microbiologie, vous avez la possibilité de poursuivre vos études avec un Doctorat quelle que soit l’ORI suivie, RIM ou MESI.
Entre 25 à 35 % des étudiants diplômés du Master Microbiologie poursuivent en doctorat.
Débouchés professionnels
Avec le Master Microbiologie de la FST, vous pouvez exercer les métiers suivants :
• cadre supérieur en recherche et développement,
• enseignant chercheur,
• chargé de recherche,
• chargé d’études,
• chef de projets,
• chargé de mission
• responsable de laboratoire d’analyses,
• ingénieur d’études,
• responsables de production,
• ingénieur responsable qualité.
Environ 80 % des diplômés sont en activité au moins un an après le diplôme.
Le Master Microbiologie à la FST vous ouvre des débouchés professionnels dans une grande diversité de secteurs
d’activité :
• agro-alimentaire,
• hygiène,
• santé et environnement,
• eau industrielle et de consommation humaine,
• contrôle qualité,
• gestion des ressources naturelles,
• transformation et valorisation des biomasses,
• amélioration de la santé humaine, animale et végétale,
• ingénierie des protéines,
• génie génétique…
Vous pouvez travailler dans le secteur public (universités, CNRS, ANSES, etc.), le semi-privé (Institut Pasteur, IFREMER, etc.) ou le privé (bureau d’études, entreprises).
Une vision élargie de la microbiologie
Ce Master fait intervenir des enseignants en microbiologie de quatre composantes de l’UL :
• Faculté des Sciences et Technologies,
• Faculté de Pharmacie,
• Faculté de Médecine, maïeutique et des métiers de la santé,
• ENSAIA.
Cette diversité des composantes vous apporte une vision élargie des domaines d’activités de la microbiologie. Pour cette raison, ce Master Microbiologie de la FST est l’un des Masters en Microbiologie les plus complets de l’hexagone.
Ouverture à l’internationale
Le Master Microbiologie met l’accent sur l’anglais scientifique dans plusieurs unités d’enseignement :
• UE Anglais scientifique,
• UE Veille technologique et scientifique,
• UE Biostatistiques,
• UE Bio-informatique.
Dans ces UE, les enseignements et restitutions sont réalisés en anglais.
Vous pouvez faire votre stage à l’étranger, rédiger votre rapport en anglais et défendre oralement votre mémoire dans la langue de Shakespeare.
L’ORI RIM de M2 est susceptible d’accueillir des étudiants anglophones européens ou non.
Ouverture sur la Recherche académique et le monde de l’entreprise
Durant vos deux années dans le Master Microbiologie, vous suivez des Unités d’Enseignement (UE) qui sont transversales à toutes les orientations :
• communication scientifique internationale (conférence scientifique, rédaction d’article en anglais, anglais scientifique, etc.),
• insertion professionnelle (rencontres avec des professionnels, aide à la définition du projet professionnel, aide à l’insertion professionnelle, etc.),
• et méthodologie de gestion de projet.
Ces UE vous ouvrent à la fois les portes du monde de la recherche et de l’entreprise.
L’association les BIoMANE
L’association Les BioMANE (Biotechnologies Microbiologie Aliment Nutrition Environnement) regroupe les étudiants du Master Microbiologie et du Master Nutrition et Sciences des Aliments, qui étaient autrefois regroupés en un même Master.
L’association promeut les 2 Masters auprès des écoles et entreprises de la Région.
Les membres de l’association bénéficient aussi d’un local pour socialiser et travailler en groupe.
C1 : Usage avancé et spécialisé des outils numériques.
C2 : Développement et intégration de savoirs hautement spécialisés dans le domaine de la microbiologie.
C3 : Communication spécialisée pour le transfert de connaissances.
C4 : Appui à la transformation en contexte professionnel.
C5 : Usage avancé des outils de statistiques pour résoudre des questions relatives à la microbiologie (dont la microbiologie moléculaire).
C6 : Mettre en œuvre et réaliser en autonomie une démarche expérimentale pour répondre à une problématique en microbiologie.
C7 : Caractériser et valoriser son identité, ses compétences et son projet professionnel.
Admission
Master 1 (M1)
L’équipe pédagogique examine les candidatures suivantes :
• titulaires d’une Licence Sciences de la Vie (ou équivalent),
• ou titulaires d’une autre Licence (Chimie, Physique-Chimie, Sciences de la Terre…), ou titulaire d’un autre diplôme français (BUT) ou d’un diplôme étranger équivalent.
Master 2 (M2)
• admission de droit à l’issue de la 1ère année du Master Microbiologie.
• Les autres candidatures (étudiants ayant validés une première année d’un autre master français ou étranger, diplôme équivalent, élèves-ingénieurs ayant accompli deux années de formation) et celles des étudiants en santé (médecine, pharmacie ou dentaire ayant validé la cinquième année) sont sont examinées par l’équipe pédagogique.
Il est impératif de prendre connaissance des Modalités de Contrôles des Connaissances et des Compétences (M3C) de votre formation ainsi que de la charte des examens.
Quelques témoignages d’anciens étudiants en activité via le site Linkedin du groupe Alumni du master MIC (dont le Master BioMANE, parcours microbiologie)
Pierre, Promotion 2023, Ori RIM
Institut de Génétique et Développement de Rennes (IGDR) – En Doctorat directement après son Master.
« Je suis actuellement Doctorant en 2e année au sein de l’Institut de Génétique et Développement de Rennes (IGDR). J’étais étudiant du master à l’université de Lorraine durant les années 2021-2023 et j’en garde un très bon souvenir.
La première année de Master était très dense en cours théoriques et très peu de pratiques. Néanmoins, cela m’a permis d’acquérir des bases solides en Microbiologie générale que j’utilise encore actuellement. Par ailleurs, la deuxième année (orientation RIM) était excellente du point de vue de la formation pour devenir un futur chercheur. Ces « petits stages » en équipe (immersion en laboratoire) et sur des sujets différents m’ont permis de découvrir des méthodes d’analyses de pointes en microbiologie (Bioinformatique / Genomique / RNAseq / expression protéine et étude de leurs fonctions). De plus, travailler sur de vrais sujets au laboratoire était captivant.
Je recommande à tous les étudiants en microbio ayant une appétence pour la recherche d’effectuer le parcours RIM. J’y ai appris comment mener une démarche expérimentale scientifique et comment travailler en équipe (ce qui est primordial en recherche académique). »
Ludovic, Promotion 2023, Ori MESI
En CDD directement à la suite de son stage, CDI 2 mois après.
« Je suis actuellement adjoint QHSE dans l’agroalimentaire.
Avec 1 an et demi de recul, je pense que le Master (orientation MESI) m’a permis d’avoir un mode de réflexion et des compétences transverses. On apprend beaucoup de théorie, mais la pratique reste très différente. Et les compétences pratiques dans le cadre de mon métier, je les ai acquises au cours de mon activité professionnelle. C’est pourquoi, c’est une très bonne chose que l’apprentissage soit à présent possible dans le Master.
La très grande majorité de ce que j’ai appris en terme recherche ou microbiologie en général ne me sert pas directement. »
Maude, Promotion 2017, ORI MInd
Eurofins – 1er Emploi en CDD obtenu 6 mois après le diplôme.
« J’occupe actuellement un poste de responsable qualité et responsable métrologie dans un laboratoire qui analyse de la poudre de lait infantile.
J’ai fini le Master en juillet 2017.
Le Master m’a permis d’avoir une bonne compréhension des processus analytiques utilisés par nos clients, comme la pasteurisation.
Une compréhension des analyses en Microbiologie et une connaissance des germes recherchés. Ça me permet d’auditer le service technique et d’avoir des échanges constructifs avec le responsable technique du service qui peut me consulter lorsqu’il réalise les études d’impact lors de changement normatif, ou lorsqu’il souhaite avoir un avis sur la mise en place d’amélioration.»
Justine, Promotion 2024, Orientation RIM
CDD juste à la suite du Master Microbiologie
« Venant d’intégrer le milieu professionnel (QHE Officer / Ingénieure Chargée QHE (Qualité Hygiène Environnement, Agro-alimentaire) directement après le Master Microbiologie (sans poursuite d’études, pas de doctorat), le Master m’a apporté beaucoup de connaissances dans le domaine de la microbiologie environnementale et médicale, notamment sur l’antibiorésistance.
J’ai aussi pu avoir des cours de qualité et de sécurité qui me sont utiles dans mon métier aujourd’hui. Je pense que les cours avec les projets en groupe et la communication nous sont également utiles pour les compétences transversales.
Cependant, durant mon stage par exemple, il m’a été dit que le Master Microbiologie était trop tourné vers la recherche et pas assez vers le domaine de l’industrie, particulièrement l’industrie agro-alimentaire, ce qui pouvait pêcher dans mon orientation professionnelle et dans la maîtrise de certaines compétences pour ce milieu. Mais cela ne m’a pas empêché de trouver un emploi à la hauteur de mes attentes. »
Marion, Promotion 2016, ORI Mind
Juste après le Master : CDD Tech pendant 1 an, puis Ingénieure
« Je suis aujourd’hui Responsable en Recherche et Développement (R&D) dans une entreprise de petfood (en passant par Ingénieure R&D au préalable).
Le Master Microbiologie m’a aidé à me former sur la gestion de projet, sur la maîtrise de l’aliment et en quoi les procédés fermentaires peuvent aider sur la santé animale par exemple.
Le Master m’a également aidé à travailler sur ma vision globale d’un projet, et ma réflexion globale au quotidien, à chercher dans le détail les éléments par exemple et savoir “comment chercher”. »
Lise, Promotion 2020, ORI MES
CDI Cadre Microbiologiste dans l’industrie des cosmétiques, Bettembourg, Luxembourg.
« Je garde un très bon souvenir du Master Microbiologie et je me rappelle avoir appris des choses très intéressantes. Nous avons balayé un peu tous les sujets pouvant nous servir pour notre carrière future. Pour certaines matières, j’ai quand même trouvé dommage qu’il y ait beaucoup de “par cœur” et que l’importance de la compréhension était moindre même si je comprends l’intérêt.
De manière globale, je conseillerais ce Master, qui m’a donné les clés nécessaires pour me lancer dans ma carrière professionnelle. Je le recommanderais très clairement à des étudiants ayant un projet professionnel dans la Microbiologie : il donne toutes les cartes en main pour un avenir dans ce domaine. Et l’intitulé du Master Microbiologie est plutôt bien compris et reconnu par les employeurs.
Le Master Microbiologie m’a permis de démarrer ma carrière professionnelle, car mon stage de fin d’étude a débouché directement sur mon premier emploi. Les connaissances que j’ai eues en master m’ont aidée à participer à de nombreux projets. il m’est même arrivé de ressortir des cours lors de ma carrière professionnelle pour chercher des informations dont j’avais besoin (cours sur les biofilms ou cours sur le séquençage et la génétique). »
Abderrahim, Promotion 2020
Ingénieur CDI, fermentation en industrie, France.
« Le Master Microbiologie, que j’ai suivi entre 2017 et 2020 s’est révélé particulièrement enrichissant et bénéfique à plusieurs niveaux :
1. **Approche métabolique appliquée à l’industrie**
Cette formation m’a permis d’acquérir une compréhension approfondie des processus métaboliques, ce qui a été un atout majeur pour travailler en milieu industriel. Cette vision globale a facilité mon adaptation et ma contribution à des projets axés sur la microbiologie appliquée.
2. **Interactions interdisciplinaires**
Grâce à cette formation, j’ai eu l’opportunité d’interagir avec des équipes clés, notamment celle de biologie moléculaire. Ces échanges ont renforcé ma capacité à travailler en synergie avec des experts de disciplines complémentaires.
3. **Collaboration avec le contrôle qualité**
J’ai également pu collaborer étroitement avec le responsable contrôle qualité, ce qui m’a permis de mieux comprendre les exigences industrielles en matière de conformité et d’assurance qualité.
4. **Apports des enseignements en commun avec l’ENSAIA**
Les cours partagés avec l’ENSAIA ont été un véritable atout. Ils m’ont aidé à développer des compétences en extrapolation et à appréhender les différents enjeux industriels. Cela m’a permis d’acquérir une vision stratégique et une meilleure compréhension des besoins du secteur.
En parallèle, j’ai également suivi des enseignements en rédaction scientifique, en dehors de cette formation. Ces enseignements m’ont permis d’améliorer mes compétences en communication écrite, me permettant de transmettre des informations complexes de manière concise et efficace, ce qui est un atout précieux dans mon travail actuel.
En somme, cette formation a non seulement enrichi mes connaissances scientifiques et techniques, mais elle a également renforcé ma capacité à travailler dans un environnement industriel multidisciplinaire. »
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